Superviseur de la Compagnie des Philippines et premier facteur de la Compagnie royale des Philippines en Chine (1787-1796), Manuel de Agote y Bonaechea nous a laissé le témoignage de ses pérégrinations nautiques et commerciales le long des eaux et des côtes de l'Atlantique, de l'océan Indien et surtout du Pacifique entre 1779 et 1798. En tant que membre d'équipage, passager ou facteur de la Royal Philippine Company à Canton, il nous fournit, dans une série de journaux, dont certains de navigation, de précieuses informations de nature diverse, consacrant un large espace aux nouvelles de nature géographique.

Il a payé la première statue du navigateur Elcano, érigée en 1800 et détruite lors du siège de 1836. À l'occasion de l'inauguration de la statue, des vers ont été écrits en basque, dédiés à Agote.